数据集概述
本数据集为秀丽隐杆线虫行为数据库的一部分,记录了RB873品系(携带lig-4基因ok716突变体)成年雌雄同体线虫的行为实验数据。实验于2011年8月开展,通过tierpsy软件追踪线虫在NGM培养基上的行为,包含视频原始数据、特征提取数据及标准化格式数据,可用于分析该基因突变体的行为表型。
文件详解
- 核心数据文件
- 文件名称:lig-4 (ok716)I on food L_2011_08_19__15_17_58110.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储线虫行为实验的原始追踪数据,包含视频帧、骨架分割信息等基础数据
- 文件名称:lig-4 (ok716)I on food L_2011_08_19__15_17_58110_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储提取的线虫行为特征数据,基于tierpsy软件分析得到
- 文件名称:lig-4 (ok716)I on food L_2011_08_19__15_17_58110.wcon.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:包含wcon格式的线虫行为数据压缩包,用于标准化数据交换
数据来源
C.elegans behavioural database(http://movement.openworm.org)
适用场景
- 线虫基因功能研究: 分析lig-4基因ok716突变体对秀丽隐杆线虫行为表型的影响
- 行为学实验方法验证: 基于E. Yemini等的实验方法,验证线虫行为追踪技术的可靠性
- 生物信息学工具应用: 评估tierpsy软件在秀丽隐杆线虫行为特征提取中的性能
- 模式生物行为数据库构建: 补充秀丽隐杆线虫行为数据库的基因突变体实验数据
- 基因与行为关联分析: 探究DNA修复相关基因(lig-4)与线虫运动行为的关联机制