C_elegans_Based_RB919_snf_1_ok790_I秀丽隐杆线虫行为实验数据集

数据集概述

本数据集为秀丽隐杆线虫(C.elegans)行为数据库的一部分,记录了RB919品系(snf-1(ok790)I基因突变)成年雌雄同体线虫的行为实验数据。实验在含OP50食物的NGM低蛋白胨琼脂培养基中进行,通过视频追踪获取线虫运动特征,包含原始追踪、行为特征及标准化格式文件,支持线虫基因功能与行为关联研究。

文件详解

  • 核心数据文件
  • 文件名称:snf-1 (ok790)I on food L_2009_11_18__15_55_52__12.hdf5
  • 文件格式:HDF5
  • 字段映射介绍:存储线虫行为追踪的原始数据,包含视频帧对应的线虫骨架坐标、运动参数等基础追踪信息
  • 特征数据文件
  • 文件名称:snf-1 (ok790)I on food L_2009_11_18__15_55_52__12_features.hdf5
  • 文件格式:HDF5
  • 字段映射介绍:包含提取的线虫行为特征数据,如运动速度、弯曲频率、轨迹模式等量化指标
  • 标准化格式文件
  • 文件名称:snf-1 (ok790)I on food L_2009_11_18__15_55_52__12.wcon.zip
  • 文件格式:ZIP(内含wcon格式文件)
  • 字段映射介绍:采用线虫行为数据标准化格式(wcon)存储的行为时间序列数据,便于跨平台共享与分析

数据来源

C.elegans behavioural database(http://movement.openworm.org

适用场景

  • 线虫基因功能研究: 分析snf-1基因缺失对秀丽隐杆线虫觅食、运动等行为的影响
  • 行为表型分析: 基于视频追踪特征数据,量化基因突变线虫的行为表型差异
  • 神经生物学研究: 探究snf-1基因相关信号通路与线虫行为调控的关联机制
  • 模式生物实验方法验证: 验证基于tierpsy软件的线虫行为追踪与特征提取方法的可靠性
  • 生物数据库补充: 作为秀丽隐杆线虫行为数据库的组成部分,支持大规模线虫行为数据的整合分析
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数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 290.82 MiB
最后更新 2026年1月8日
创建于 2026年1月8日
声明 当前数据集部分源数据来源于公开互联网,如果有侵权,请24小时联系删除(400-600-6816)。