数据集概述
本数据集为秀丽隐杆线虫(C.elegans)行为数据库的一部分,记录了RB919品系(snf-1(ok790)I基因突变)成年雌雄同体线虫的行为实验数据。实验在含OP50食物的NGM低蛋白胨琼脂培养基中进行,通过视频追踪获取线虫运动特征,包含原始追踪、行为特征及标准化格式文件,支持线虫基因功能与行为关联研究。
文件详解
- 核心数据文件
- 文件名称:snf-1 (ok790)I on food L_2009_11_18__15_55_52__12.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储线虫行为追踪的原始数据,包含视频帧对应的线虫骨架坐标、运动参数等基础追踪信息
- 特征数据文件
- 文件名称:snf-1 (ok790)I on food L_2009_11_18__15_55_52__12_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:包含提取的线虫行为特征数据,如运动速度、弯曲频率、轨迹模式等量化指标
- 标准化格式文件
- 文件名称:snf-1 (ok790)I on food L_2009_11_18__15_55_52__12.wcon.zip
- 文件格式:ZIP(内含wcon格式文件)
- 字段映射介绍:采用线虫行为数据标准化格式(wcon)存储的行为时间序列数据,便于跨平台共享与分析
数据来源
C.elegans behavioural database(http://movement.openworm.org)
适用场景
- 线虫基因功能研究: 分析snf-1基因缺失对秀丽隐杆线虫觅食、运动等行为的影响
- 行为表型分析: 基于视频追踪特征数据,量化基因突变线虫的行为表型差异
- 神经生物学研究: 探究snf-1基因相关信号通路与线虫行为调控的关联机制
- 模式生物实验方法验证: 验证基于tierpsy软件的线虫行为追踪与特征提取方法的可靠性
- 生物数据库补充: 作为秀丽隐杆线虫行为数据库的组成部分,支持大规模线虫行为数据的整合分析