数据集概述
本数据集为秀丽隐杆线虫(C.elegans)RB946 ric-19(ok833)菌株的行为实验数据,属于线虫行为数据库的一部分。记录了成年雌雄同体线虫在特定培养条件下的行为特征,包含视频跟踪数据、特征提取结果及标准化格式文件,可用于分析该基因突变株的行为表型。
文件详解
- 核心数据文件
- 文件名称:ric-19 (ok833) on food L_2011_08_04__11_33_37__4.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储线虫行为实验的原始跟踪数据,包含26494个分段骨架信息,记录线虫运动的空间坐标及时序变化
- 特征提取文件
- 文件名称:ric-19 (ok833) on food L_2011_08_04__11_33_37__4_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:包含从原始数据中提取的线虫行为特征参数,支持行为表型分析
- 标准化格式文件
- 文件名称:ric-19 (ok833) on food L_2011_08_04__11_33_37__4.wcon.zip
- 文件格式:ZIP(内含wcon格式文件)
- 字段映射介绍:采用wcon标准化格式存储的线虫行为数据,便于跨平台共享与分析
数据来源
C.elegans behavioural database(http://movement.openworm.org)
适用场景
- 线虫行为遗传学研究: 分析ric-19基因突变对秀丽隐杆线虫运动行为的影响
- 神经生物学机制探索: 研究ric-19基因在调控线虫行为中的作用机制
- 模式生物行为表型分析: 建立基因突变株与行为表型的关联模型
- 生物信息学算法验证: 用于测试和优化线虫行为特征提取算法的准确性
- 药物筛选辅助研究: 作为基准数据评估药物对线虫行为的影响