数据集概述
本数据集为秀丽隐杆线虫(C.elegans)RB1816品系(携带gpa-16(ok2349)I等位基因)的行为实验数据,属于线虫行为数据库的一部分。记录了成年雌雄同体线虫在特定培养条件下的行为观测结果,包含视频特征、行为轨迹等结构化数据,用于研究gpa-16基因对其行为的影响。
文件详解
- 行为特征文件:
- 文件名称:
gpa-16 (ok2349)I on food L_2010_03_11__11_06_34___4___4_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储线虫行为特征数据,具体字段基于tierpsy软件分析结果,包含行为轨迹、运动参数等特征。
- 行为数据压缩文件:
- 文件名称:
gpa-16 (ok2349)I on food L_2010_03_11__11_06_34___4___4.wcon.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:压缩存储的行为数据文件,格式为wcon(线虫行为数据标准格式)。
- 核心数据文件:
- 文件名称:
gpa-16 (ok2349)I on food L_2010_03_11__11_06_34___4___4.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:包含实验核心数据,可能涵盖视频帧、骨架分割等原始或处理后的数据,支持行为分析。
数据来源
C.elegans behavioural database(http://movement.openworm.org)
适用场景
- 线虫行为遗传学研究: 分析gpa-16基因对秀丽隐杆线虫运动行为的调控机制。
- 基因功能验证: 通过对比野生型与突变体行为差异,验证gpa-16基因的生物学功能。
- 行为学实验方法优化: 参考实验设计(如 habituation 时长、培养条件)优化线虫行为观测方案。
- 生物信息学工具评估: 基于tierpsy软件生成的特征数据,评估行为分析工具的准确性与适用性。