数据集概述
本数据集属于秀丽隐杆线虫(C.elegans)行为数据库的一部分,记录了AQ2197 ser-5(tm2654)I品系线虫的行为实验数据。实验于2009年12月17日开展,采用NGM低蛋白胨培养基和OP50食物源,包含视频追踪及行为特征提取结果,支持线虫基因功能与行为关系的研究。
文件详解
- 行为数据压缩包
- 文件名称:
ser-5 (ok2654) on food R_2009_12_17__12_23_44___4___5.wcon.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:包含线虫行为轨迹的原始数据压缩文件,推测存储标准化行为数据格式(wcon)的内容
- 行为特征主文件
- 文件名称:
ser-5 (ok2654) on food R_2009_12_17__12_23_44___4___5.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储线虫行为实验的核心数据,可能包含轨迹坐标、时间序列等基础行为记录
- 行为特征提取文件
- 文件名称:
ser-5 (ok2654) on food R_2009_12_17__12_23_44___4___5_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储经tierpsy软件提取的线虫行为特征数据,包含运动参数、姿态特征等分析指标
数据来源
C.elegans behavioural database(http://movement.openworm.org)
适用场景
- 线虫基因功能研究: 分析ser-5基因对秀丽隐杆线虫行为模式的影响,探究基因与行为的关联机制
- 行为学实验方法验证: 基于标准化实验方案(E. Yemini et al.方法),验证线虫行为实验的可重复性
- 模式生物行为分析: 利用轨迹与特征数据,研究线虫在特定食物源和培养条件下的行为规律
- 生物信息工具应用: 基于tierpsy软件的特征提取结果,评估行为分析工具在模式生物研究中的效能