数据集概述
本数据集为秀丽隐杆线虫(C.elegans)CB1069 unc-80(e1069)V突变株的行为实验数据,属于线虫行为数据库的一部分。记录了成年雌雄同体线虫在含OP50食物的NGM培养基上的行为特征,包括运动轨迹、骨架分割等数据,由MRC分子生物学实验室采用tierpsy软件采集分析,是研究unc-80基因功能与线虫行为关联的基础数据。
文件详解
- 文件1:
unc-80 (e1069) on food L_2010_04_14__14_57_46___6___12.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:包含实验原始行为数据,可能涵盖线虫运动轨迹的时间序列、坐标信息等基础观测数据
- 文件2:
unc-80 (e1069) on food L_2010_04_14__14_57_46___6___12_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:包含行为特征提取数据,对应19693个分割骨架的特征参数,可能涉及运动速度、弯曲度等行为学指标
- 文件3:
unc-80 (e1069) on food L_2010_04_14__14_57_46___6___12.wcon.zip
- 文件格式:ZIP(压缩包)
- 字段映射介绍:包含wcon格式的行为数据压缩文件,可能存储标准化的线虫行为描述信息
数据来源
C.elegans behavioural database(线虫行为数据库)
适用场景
- 基因突变与行为表型关联研究: 分析unc-80(e1069)V突变对秀丽隐杆线虫运动行为的影响,探究基因功能
- 线虫行为学特征分析: 基于骨架分割和特征数据,研究线虫在食物环境中的运动模式、轨迹规律
- 模式生物实验方法验证: 参考实验 protocol(Yemini et al. 方法),验证线虫行为实验的标准化流程
- 行为分析软件应用评估: 基于tierpsy软件采集的数据集,评估该工具在模式生物行为特征提取中的性能
- 神经遗传学基础研究: 结合基因背景与行为数据,探索神经系统相关基因对行为调控的分子机制