数据集概述
本数据集为秀丽隐杆线虫(C.elegans)行为数据库的一部分,记录了VC1243株系(T14B1.1基因ok1702等位基因敲除)成年雌雄同体线虫在含OP50食物的NGM培养基上的行为实验数据。实验由William R Schafer实验室完成,包含视频追踪原始数据、特征提取结果等,可用于分析线虫的运动行为特征。
文件详解
- 文件名称:T14B1.1 (ok1702) on food L_2011_09_06__13_13_06__5.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:推测包含线虫行为视频的原始追踪数据,如骨架坐标、运动轨迹等基础行为信息
- 文件名称:T14B1.1 (ok1702) on food L_2011_09_06__13_13_06__5.wcon.zip
- 文件格式:ZIP(含wcon文件)
- 字段映射介绍:压缩包内可能为线虫行为数据交换格式(WCOn)文件,记录标准化的行为时间序列数据
- 文件名称:T14B1.1 (ok1702) on food L_2011_09_06__13_13_06__5_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:包含提取的线虫行为特征数据,如运动速度、弯曲频率等量化指标
数据来源
C.elegans behavioural database(http://movement.openworm.org)
适用场景
- 线虫基因功能研究: 分析T14B1.1基因敲除对秀丽隐杆线虫运动行为的影响
- 行为学实验方法验证: 基于标准实验方案(E. Yemini et al.方法)的行为数据可用于验证线虫行为分析流程
- 线虫行为特征提取算法测试: 提供标注好的行为数据,用于测试和优化行为特征提取软件
- 模式生物行为数据库补充: 作为公开线虫行为数据库的一部分,支持大规模线虫行为数据的整合分析