数据集概述
本数据集为秀丽隐杆线虫(C.elegans)行为数据库的一部分,记录了VC1309品系(携带nlp-8基因ok1799突变)成年雌雄同体线虫的行为实验数据。实验于2010年3月17日开展,包含线虫在NGM低蛋白胨琼脂培养基上的行为观测数据,涉及实验条件、视频参数及行为特征提取结果,共计3个文件。
文件详解
- 行为特征数据文件
- 文件名称:nlp-8 (ok1799)I on food R_2010_03_17__11_37_2485_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储线虫行为特征提取结果,包含19026个分段骨架数据,对应实验总时长898.934秒、帧率25.5102帧/秒等参数
- 核心行为数据文件
- 文件名称:nlp-8 (ok1799)I on food R_2010_03_17__11_37_2485.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储线虫行为实验核心数据,与特征文件配套使用
- 压缩行为数据文件
- 文件名称:nlp-8 (ok1799)I on food R_2010_03_17__11_37_2485.wcon.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:压缩格式的线虫行为数据文件,包含实验相关的行为记录信息
数据来源
C.elegans behavioural database
适用场景
- 线虫基因功能研究: 分析nlp-8基因ok1799突变对秀丽隐杆线虫行为模式的影响
- 神经生物学实验验证: 基于行为特征数据验证线虫神经回路与行为表型的关联
- 行为分析方法优化: 利用tierpsy软件提取的骨架数据,优化线虫行为特征提取算法
- 模式生物实验标准化: 参考实验协议(E. Yemini et al.方法)建立标准化线虫行为实验流程
- 生物图像分析应用: 基于视频像素与微米映射关系(4.20853微米/像素),开展线虫行为的定量图像分析