数据集概述
本数据集是秀丽隐杆线虫(C.elegans)行为数据库的一部分,记录了VC8品系jnk-1(gk7)IV成年雌雄同体线虫在含OP50食物的NGM低蛋白胨琼脂培养皿中的行为实验数据。实验由MRC分子生物学实验室完成,使用tierpsy软件追踪分析,包含视频及行为特征数据,可用于研究jnk-1基因对线虫行为的影响。
文件详解
- 核心数据文件(.hdf5格式)
- 文件名称:jnk-1 (gk1)IV on food R_2011_08_04__12_5038.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:包含线虫行为追踪的原始数据,如视频帧对应的线虫形态、位置等基础信息
- 特征数据文件(.hdf5格式)
- 文件名称:jnk-1 (gk1)IV on food R_2011_08_04__12_5038_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:包含提取的线虫行为特征数据,基于tierpsy软件分析得到
- 行为数据压缩包(.zip格式)
- 文件名称:jnk-1 (gk1)IV on food R_2011_08_04__12_5038.wcon.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:包含wcon格式的线虫行为数据压缩文件,用于存储标准化的行为记录
数据来源
C.elegans behavioural database(http://movement.openworm.org)
适用场景
- 基因功能研究: 分析jnk-1基因缺失(gk7突变)对线虫运动行为的影响
- 线虫行为学分析: 基于追踪数据研究线虫在食物环境中的运动模式、速度等行为特征
- 神经生物学研究: 探究jnk-1基因相关信号通路对线虫行为调控的机制
- 实验方法验证: 参考E. Yemini等人的实验方法,开展同类线虫行为实验的方法学验证
- 行为数据分析工具测试: 用于tierpsy等线虫行为追踪软件的功能测试与优化