数据集概述
本数据集为秀丽隐杆线虫VC8 jnk-1(gk7)IV品系的行为实验数据,属于C.elegans行为数据库的一部分。记录了成年雌雄同体线虫在NGM低蛋白胨琼脂培养基、OP50食物条件下的行为特征,包含视频追踪数据及提取的行为特征,可用于研究jnk-1基因对秀丽隐杆线虫行为的影响。
文件详解
- jnk-1 (gk1)IV on food R_2011_08_25__15_21_1268.wcon.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:包含实验相关的WCON格式压缩数据,为行为数据的归档文件
- jnk-1 (gk1)IV on food R_2011_08_25__15_21_1268.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储实验的核心行为数据,可能包含线虫运动轨迹、时间序列等原始追踪信息
- jnk-1 (gk1)IV on food R_2011_08_25__15_21_1268_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储提取的行为特征数据,基于tierpsy软件分析得到,包含26252个分段骨架等特征
数据来源
C.elegans behavioural database(http://movement.openworm.org)
适用场景
- 线虫基因功能研究: 分析jnk-1(gk7)IV突变体的行为表型,探究jnk-1基因在秀丽隐杆线虫行为调控中的作用
- 行为学实验方法验证: 基于E. Yemini等人的实验方法,验证线虫行为实验的标准化流程及数据采集技术
- 线虫行为特征提取算法评估: 以本数据为基础,评估tierpsy软件提取线虫行为特征的准确性与有效性
- 分子生物学与行为学关联分析: 结合基因背景与行为数据,研究基因变异对模式生物行为的分子机制