数据集概述
本数据集为秀丽隐杆线虫(C.elegans)行为数据库的一部分,记录了RB1832品系(acc-4基因ok2371突变体)成虫在含OP50食物的NGM培养基上的行为实验数据,包含视频追踪原始数据、特征提取结果及标准化格式文件,可用于分析线虫基因功能与行为表型的关联。
文件详解
- 行为数据压缩包
- 文件名称:T27E9.9 (ok2371)III on food l_2011_09_15__12_39_1525.wcon.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:包含线虫行为数据的标准化wcon格式压缩文件,记录实验过程中线虫的运动轨迹等核心行为数据
- 特征提取文件
- 文件名称:T27E9.9 (ok2371)III on food l_2011_09_15__12_39_1525_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:由tierpsy软件提取的线虫行为特征数据文件,包含26885个分割骨架的特征信息
- 原始追踪数据文件
- 文件名称:T27E9.9 (ok2371)III on food l_2011_09_15__12_39_1525.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:记录实验原始追踪数据,实验总时长899秒,帧率30.03帧/秒,像素分辨率4.48768微米/像素
数据来源
C.elegans behavioural database(http://movement.openworm.org)
适用场景
- 线虫基因功能研究: 分析acc-4基因ok2371突变对秀丽隐杆线虫行为表型的影响
- 神经生物学实验: 探究线虫神经递质受体基因与运动行为的关联机制
- 行为学数据分析方法验证: 基于标准化wcon格式数据验证行为特征提取算法的有效性
- 模式生物实验复现: 为同类秀丽隐杆线虫行为实验提供可参考的实验设计与数据格式范例