数据集概述
本数据集为秀丽隐杆线虫行为数据库的一部分,记录了ASIC-2基因敲除株(RB557 asic-2(ok289)I)的行为实验数据。实验在NGM低蛋白胨琼脂培养基上进行,使用Tierpsy软件追踪线虫运动,包含原始视频处理结果、特征提取数据及标准化行为数据文件,可用于分析该基因对秀丽隐杆线虫行为的影响。
文件详解
- 行为追踪原始数据文件
- 文件名称:T2854.2 (ok289) on food R_2010_03_25__15_45_13610.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:包含线虫行为追踪的原始数据,记录实验过程中线虫的运动轨迹、骨架 segmentation 信息等基础观测数据
- 行为特征提取文件
- 文件名称:T2854.2 (ok289) on food R_2010_03_25__15_45_13610_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:包含从原始追踪数据中提取的行为特征,如运动速度、身体弯曲度、头部摆动频率等量化指标
- 标准化行为数据压缩包
- 文件名称:T2854.2 (ok289) on food R_2010_03_25__15_45_13610.wcon.zip
- 文件格式:ZIP(内含wcon格式文件)
- 字段映射介绍:包含标准化的线虫行为数据,采用WCON(Worm Behavior Ontology)格式,便于跨平台的行为数据共享与分析
数据来源
C.elegans behavioural database(http://movement.openworm.org)
适用场景
- 基因功能研究: 分析ASIC-2基因敲除对秀丽隐杆线虫运动行为、觅食行为等表型的影响
- 神经生物学机制探索: 研究ASIC-2离子通道在秀丽隐杆线虫神经调控中的作用
- 行为学实验方法验证: 验证Tierpsy软件在秀丽隐杆线虫行为追踪中的准确性与可靠性
- 基因-行为关联分析: 构建ASIC-2基因表达与线虫特定行为表型的关联模型
- 药物筛选参考: 作为ASIC-2相关药物筛选的行为学实验基线数据