数据集概述
本数据集为秀丽隐杆线虫行为数据库的一部分,记录了BZ28品系(基因型snf-6(eg28)III)成年雌雄同体线虫在含OP50食物的NGM琼脂培养基中的行为实验数据。实验于2010年10月1日开展,包含视频跟踪数据及行为特征提取结果,可用于分析该基因突变体的行为表型。
文件详解
- 行为特征数据文件
- 文件名称:snf-6 (eg28)III on food L_2010_10_01__13_05_59__5_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:包含线虫行为特征提取结果,基于tierpsy软件分析生成
- 核心实验数据文件
- 文件名称:snf-6 (eg28)III on food L_2010_10_01__13_05_59__5.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储实验核心数据,包含26524个分段骨架数据,帧率30.03帧/秒,视频像素对应4.56732微米
- 行为数据压缩文件
- 文件名称:snf-6 (eg28)III on food L_2010_10_01__13_05_59__5.wcon.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:压缩存储线虫行为数据,采用wcon格式
数据来源
C.elegans behavioural database(http://movement.openworm.org)
适用场景
- 线虫基因突变体行为表型分析: 研究snf-6(eg28)突变对秀丽隐杆线虫觅食、运动等行为的影响
- 神经遗传学研究: 结合基因型与行为数据,探索snf-6基因在神经调控中的功能
- 行为实验方法验证: 基于E. Yemini等人的实验方案,验证线虫行为学实验的可重复性
- 模式生物行为数据库补充: 为秀丽隐杆线虫行为数据库提供标准化的突变体实验数据