数据集概述
本数据集为秀丽隐杆线虫行为数据库的组成部分,记录了CB1141(cat-4(e1141)V)菌株成年雌雄同体线虫的行为实验数据。实验于2010年7月23日开展,使用NGM低蛋白胨琼脂培养基和OP50食物源,通过tierpsy软件追踪分析线虫行为,包含原始追踪、特征提取及标准化格式三类文件。
文件详解
- 核心数据文件
- 文件名称:
cat-4 (e1141)I on food L_2010_07_23__10_37_38__2.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:包含线虫行为追踪的原始数据,如26840个分割骨架的时空坐标信息,对应实验总时长899秒、帧率30.03帧/秒的观测记录。
- 特征提取文件
- 文件名称:
cat-4 (e1141)I on food L_2010_07_23__10_37_38__2_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:由tierpsy软件生成的行为特征数据,涵盖线虫运动轨迹、体态变化等量化特征,基于原始骨架数据提取。
- 标准化格式文件
- 文件名称:
cat-4 (e1141)I on food L_2010_07_23__10_37_38__2.wcon.zip
- 文件格式:ZIP(内含wcon格式文件)
- 字段映射介绍:采用wcon标准化格式存储的线虫行为数据,便于跨平台共享与分析,包含实验基本参数与核心行为指标。
数据来源
C.elegans behavioural database(http://movement.openworm.org)
适用场景
- 线虫行为学研究: 分析CB1141菌株线虫的运动模式、觅食行为等基础行为特征。
- 基因功能验证: 探究cat-4基因(e1141等位基因)对秀丽隐杆线虫行为表型的影响。
- 实验方法复现: 基于Yemini等人的实验方法,验证线虫行为实验的标准化流程。
- 行为分析软件评估: 以tierpsy软件提取的特征数据为基础,评估行为追踪工具的性能。
- 模式生物数据库补充: 作为秀丽隐杆线虫行为数据库的组成部分,支持大规模行为数据的整合研究。