数据集概述
本数据集为秀丽隐杆线虫(C.elegans)MT1231品系(携带egl-23(n601)IV突变)的行为实验数据,记录了成虫在NGM低蛋白胨琼脂培养基上的运动行为特征,包含视频处理后的骨架数据、特征数据及标准化格式数据,可用于研究该基因突变对蠕虫行为的影响。
文件详解
- 行为特征数据文件
- 文件名称:egl-23 (n601)IV on food L_2010_07_15__15_16_55811_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储线虫行为特征数据,包含由tierpsy软件提取的运动相关特征
- 原始处理数据文件
- 文件名称:egl-23 (n601)IV on food L_2010_07_15__15_16_55811.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:包含19386个分段骨架数据,记录线虫运动的空间结构信息
- 标准化格式压缩文件
- 文件名称:egl-23 (n601)IV on food L_2010_07_15__15_16_55811.wcon.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:压缩包内为wcon格式文件,存储标准化的线虫行为数据
数据来源
C.elegans behavioural database(http://movement.openworm.org)
适用场景
- 线虫遗传学研究:分析egl-23(n601)突变对秀丽隐杆线虫运动行为的影响机制
- 行为特征提取算法验证:基于tierpsy软件输出的骨架数据,验证蠕虫行为特征提取方法的有效性
- 线虫行为标准化研究:利用wcon格式数据开展模式生物行为数据的标准化存储与共享研究
- 实验室行为实验复现:为重复该品系线虫的行为实验提供原始数据参考