数据集概述
本数据集为秀丽隐杆线虫(C.elegans)MT2246品系(携带egl-43(n1079)II基因突变)的行为实验数据,包含实验条件记录、视频追踪数据及特征提取结果,属于秀丽隐杆线虫行为数据库的一部分,用于研究该基因突变对成虫行为的影响。
文件详解
- 行为特征文件:
- 文件名称:egl-43 (n1079)II on food L_2010_07_15__15_54_09613_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:包含线虫行为特征数据,由tierpsy软件提取,涉及运动轨迹、骨架分段等行为参数
- 原始追踪数据文件:
- 文件名称:egl-43 (n1079)II on food L_2010_07_15__15_54_09613.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储实验视频的原始追踪数据,包括每帧线虫的位置、姿态等基础信息
- 压缩行为数据文件:
- 文件名称:egl-43 (n1079)II on food L_2010_07_15__15_54_09613.wcon.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:压缩格式的线虫行为数据文件,包含标准化的行为记录数据
数据来源
C.elegans behavioural database(http://movement.openworm.org)
适用场景
- 基因功能研究:分析egl-43(n1079)基因突变对秀丽隐杆线虫成虫行为的影响
- 线虫行为学分析:基于视频追踪数据研究线虫在食物环境中的运动模式、觅食行为等特征
- 行为特征提取验证:验证tierpsy软件在线虫行为特征提取中的准确性与可靠性
- 实验方法复现:参考实验协议(如Yemini等的方法)复现线虫基因行为学实验
- 跨实验室数据整合:作为公开线虫行为数据库的一部分,支持多实验数据的联合分析