数据集概述
本数据集为秀丽隐杆线虫行为数据库的一部分,记录了MT1205品系(egl-7(n575)III基因突变体)成年雌雄同体线虫在含OP50食物的NGM琼脂培养基上的行为实验数据,包含视频追踪原始数据及特征提取结果,用于研究该基因突变对秀丽隐杆线虫行为的影响。
文件详解
- 压缩文件
- 文件名称:egl-7 (n575)III on food L_2010_05_11__17_11_33615.wcon.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:包含实验相关的行为数据压缩包,具体内容需解压后查看
- 行为数据文件
- 文件名称:egl-7 (n575)III on food L_2010_05_11__17_11_33615.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储线虫行为追踪的原始数据,包含19491个分段骨架数据,对应实验总时长899.104秒、帧率25.5754帧/秒、视频像素分辨率4.33523微米/像素
- 特征数据文件
- 文件名称:egl-7 (n575)III on food L_2010_05_11__17_11_33615_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储经tierpsy软件提取的线虫行为特征数据
数据来源
C.elegans behavioural database(http://movement.openworm.org)
适用场景
- 秀丽隐杆线虫基因突变功能研究: 分析egl-7(n575)III突变对成年线虫觅食、运动等行为的影响
- 神经生物学行为机制研究: 结合行为特征数据探究线虫行为调控的分子与神经机制
- 生物实验标准化方法验证: 基于实验方案(Yemini et al.方法)验证线虫行为实验的可重复性
- 模式生物行为数据分析算法测试: 利用原始追踪数据测试或优化线虫行为特征提取算法