数据集概述
本数据集为秀丽隐杆线虫RB1816株系(基因型gpa-16(ok2349)I)的行为实验记录,属于C.elegans行为数据库的一部分。记录了成年雌雄同体线虫在含OP50食物的NGM琼脂环境中的行为特征,包括运动轨迹、骨架 segmentation等数据,由tierpsy软件分析生成,可用于研究gpa-16基因对秀丽隐杆线虫行为的影响。
文件详解
- 文件1:gpa-16 (ok2349) on food R_2011_02_08__11_56_1214_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:包含线虫行为特征数据,具体字段基于tierpsy软件分析结果,可能涵盖运动速度、弯曲频率、身体姿态等行为学指标
- 文件2:gpa-16 (ok2349) on food R_2011_02_08__11_56_1214.wcon.zip
- 文件格式:ZIP(内含WCONTROL格式文件)
- 字段映射介绍:压缩包内为线虫行为数据的标准格式文件,可能包含时间序列的位置、姿态等原始或处理后数据
- 文件3:gpa-16 (ok2349) on food R_2011_02_08__11_56_1214.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:包含实验的核心数据,可能涵盖原始图像分析结果、骨架 segmentation数据(共26908个segmented skeletons)等基础行为数据
数据来源
C.elegans behavioural database(http://movement.openworm.org)
适用场景
- 线虫遗传学研究: 分析gpa-16基因缺失(ok2349突变)对秀丽隐杆线虫行为表型的影响
- 模式生物行为学分析: 研究成年雌雄同体线虫在食物环境中的运动模式、觅食行为特征
- 基因功能验证: 验证gpa-16基因在调控线虫行为中的作用机制
- 行为数据分析方法开发: 基于tierpsy软件生成的特征数据,优化线虫行为量化分析算法
- 神经生物学研究: 结合基因背景,探究gpa-16相关神经通路对行为的调控机制