数据集概述
本数据集属于秀丽隐杆线虫行为数据库,记录了NL1137品系(携带gpa-5(pk376)X突变)成虫在含OP50食物的NGM培养基中的行为实验数据,包含视频跟踪原始数据、特征提取数据及标准化格式数据,可用于分析该基因突变体的行为表型。
文件详解
- 原始跟踪数据文件
- 文件名称:gpa-5 (pk376)X on food L_2010_03_05__11_35_4327.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储线虫行为视频的原始跟踪数据,包含899.306秒实验时长、每秒25.7732帧的采样信息,以及线虫骨架分割数据(共19252个分割骨架)
- 行为特征数据文件
- 文件名称:gpa-5 (pk376)X on food L_2010_03_05__11_35_4327_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:基于原始跟踪数据提取的线虫行为特征数据,包含由tierpsy软件生成的运动特征参数
- 标准化格式压缩文件
- 文件名称:gpa-5 (pk376)X on food L_2010_03_05__11_35_4327.wcon.zip
- 文件格式:ZIP(含wcon格式文件)
- 字段映射介绍:采用wcon标准化格式存储的线虫行为数据压缩包,便于跨平台共享与分析
数据来源
C.elegans behavioural database(http://movement.openworm.org)
适用场景
- 线虫基因功能研究:分析gpa-5基因突变对秀丽隐杆线虫行为表型的影响
- 模式生物行为学分析:基于视频跟踪数据研究线虫的运动模式、觅食行为等特征
- 基因-行为关联分析:探索gpa-5基因与线虫行为性状的分子机制
- 行为实验方法验证:参考实验方案(Yemini et al.方法)优化线虫行为学实验设计