数据集概述
本数据集为秀丽隐杆线虫行为数据库的一部分,记录了2009年7月8日开展的JT603品系(gpb-2(sa603)I基因突变体)成年雌雄同体线虫的行为实验数据。实验在含OP50食物的NGM低蛋白胨培养基中进行,通过视频追踪获取线虫运动特征,包含原始轨迹压缩文件及特征提取文件。
文件详解
- 行为轨迹压缩文件
- 文件名称:
gpb-2 (sa603) on food R_2009_07_08__11_46__4.wcon.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:压缩包内包含线虫行为轨迹的标准化数据,记录线虫运动的空间坐标、时间序列等基础轨迹信息
- 特征提取文件
- 文件名称:
gpb-2 (sa603) on food R_2009_07_08__11_46__4_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储由tierpsy软件提取的线虫行为特征数据,包含运动速度、弯曲度、身体姿态等量化指标
- 原始追踪数据文件
- 文件名称:
gpb-2 (sa603) on food R_2009_07_08__11_46__4.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:记录视频追踪的原始数据,包含6479个分割骨架的空间坐标、时间戳及像素与微米的映射关系(4.95268微米/像素)
数据来源
C.elegans behavioural database(http://movement.openworm.org)
适用场景
- 线虫行为遗传学研究: 分析gpb-2基因突变对秀丽隐杆线虫运动模式、觅食行为的影响
- 神经生物学实验验证: 结合基因突变体特征,探究相关基因在神经调控中的作用机制
- 行为分析算法优化: 利用标注的行为轨迹数据,测试和改进线虫行为特征提取算法
- 模式生物环境适应性研究: 研究线虫在特定培养基(NGM低蛋白胨)及食物条件下的行为响应