数据集概述
本数据集为秀丽隐杆线虫行为数据库的一部分,记录了RB2059品系(ins-28基因ok2722等位基因敲除)成年雌雄同体线虫的行为实验数据。实验在NGM低蛋白胨琼脂培养皿中进行,使用tierpsy软件追踪分析,包含视频及行为特征数据,可用于研究该基因敲除对秀丽隐杆线虫行为表型的影响。
文件详解
- 行为数据压缩包
- 文件名称:ins-28 (ok2722)I on food L_2011_05_19__13_00_1027.wcon.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:包含线虫行为轨迹的标准化数据,可能涵盖时间序列、位置坐标等基础行为参数
- 特征数据文件
- 文件名称:ins-28 (ok2722)I on food L_2011_05_19__13_00_1027_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储由tierpsy软件提取的线虫行为特征数据,包含运动速度、身体弯曲度等量化指标
- 主数据文件
- 文件名称:ins-28 (ok2722)I on food L_2011_05_19__13_00_1027.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:包含实验核心数据,如26997个分割骨架数据、视频像素与微米的映射关系(4.49679微米/像素)等实验关键参数
数据来源
C.elegans behavioural database(http://movement.openworm.org)
适用场景
- 线虫基因功能研究: 分析ins-28基因敲除对秀丽隐杆线虫运动行为的影响,探索该基因在行为调控中的作用
- 行为表型分析: 基于追踪数据研究基因敲除株的运动模式、速度变化等行为特征差异
- 遗传学实验验证: 为ins-28基因相关的遗传学研究提供行为学实验数据支持
- 模式生物行为学方法优化: 参考实验设计及tierpsy软件的应用,优化线虫行为实验的标准化流程