数据集概述
本数据集为秀丽隐杆线虫(C.elegans)RB2544品系ins-4(ok3534)II基因突变体的行为实验数据,属于秀丽隐杆线虫行为数据库的一部分。记录了成年雌雄同体线虫在含OP50食物的NGM培养基上的行为特征,包含视频追踪数据及行为特征提取结果,可用于研究ins-4基因对秀丽隐杆线虫行为的影响。
文件详解
- 行为数据压缩文件
- 文件名称:ins-4 (ok3534)II on food L_2011_05_12__12_4338.wcon.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:包含秀丽隐杆线虫行为实验的原始或结构化行为数据(wcon格式),记录线虫运动轨迹等基础行为信息
- 特征数据文件
- 文件名称:ins-4 (ok3534)II on food L_2011_05_12__12_4338_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储由tierpsy软件提取的线虫行为特征数据,包含运动、体态等行为学特征指标
- 核心数据文件
- 文件名称:ins-4 (ok3534)II on food L_2011_05_12__12_4338.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:包含实验的基础数据,如视频帧信息、线虫分割骨架数据(共26915个)、像素与微米的映射关系(4.72886微米/像素)等
数据来源
C.elegans behavioural database(http://movement.openworm.org)
适用场景
- 线虫基因功能研究: 分析ins-4基因对秀丽隐杆线虫成年个体行为模式的调控作用
- 行为学实验方法验证: 基于Yemini等人的实验方法,验证标准化线虫行为实验的可重复性
- 基因突变体行为表型分析: 对比野生型与ins-4(ok3534)II突变体的行为差异,挖掘基因与行为的关联
- 生物行为特征提取算法评估: 利用tierpsy软件提取的特征数据,评估行为学特征提取工具的性能
- 神经生物学研究: 探究ins-4基因相关的神经通路对秀丽隐杆线虫摄食、运动等行为的影响机制