数据集概述
本数据集是秀丽隐杆线虫行为数据库的一部分,记录了RB873菌株(携带lig-4基因ok716等位突变)的成年雌雄同体线虫在含OP50食物的NGM培养基上的行为实验数据,包含视频追踪原始数据及特征提取结果,可用于研究lig-4基因对秀丽隐杆线虫行为的影响。
文件详解
- 文件名称:lig-4 (ok716)II on food L_2011_08_24__12_24_5468.wcon.zip
文件格式:ZIP
字段映射介绍:包含线虫行为追踪的原始视频相关压缩数据
- 文件名称:lig-4 (ok716)II on food L_2011_08_24__12_24_5468.hdf5
文件格式:HDF5
字段映射介绍:存储线虫行为实验的基础追踪数据
- 文件名称:lig-4 (ok716)II on food L_2011_08_24__12_24_5468_features.hdf5
文件格式:HDF5
字段映射介绍:包含提取的线虫行为特征数据,基于tierpsy软件分析得到,涉及26381个分段骨架等行为特征
数据来源
C.elegans behavioural database
适用场景
- 基因功能研究: 分析lig-4基因ok716突变对秀丽隐杆线虫行为的影响
- 线虫行为学分析: 基于视频追踪数据研究线虫的运动模式、觅食行为等表型特征
- 基因与行为关联分析: 探索DNA修复相关基因(lig-4)与模式生物行为表型的关联机制
- 行为实验方法验证: 参考E. Yemini等人的实验方法,验证线虫行为学实验的标准化流程