数据集概述
本数据集为秀丽隐杆线虫行为数据库的一部分,记录了MT1202品系(基因型egl-24(n572)III)成年雌雄同体线虫在含OP50食物的NGM琼脂培养皿中的行为实验数据,包含视频追踪数据及特征提取结果,可用于研究该基因突变体的行为表型。
文件详解
- 特征数据文件:
egl-24 (n572)III on food R_2010_05_13__11_14_27___6___4_features.hdf5,格式为HDF5,存储线虫行为特征数据
- 行为数据压缩文件:
egl-24 (n572)III on food R_2010_05_13__11_14_27___6___4.wcon.zip,格式为ZIP,包含wcon格式的行为数据
- 核心数据文件:
egl-24 (n572)III on food R_2010_05_13__11_14_27___6___4.hdf5,格式为HDF5,存储实验核心数据
数据来源
C.elegans behavioural database(http://movement.openworm.org)
适用场景
- 线虫基因功能研究:分析egl-24(n572)突变体的行为表型,探究该基因对秀丽隐杆线虫行为的调控作用
- 行为表型分析:基于视频追踪数据研究线虫的运动模式、觅食行为等特征
- 实验方法验证:参考实验方案(Yemini et al.方法)开展类似线虫行为实验的方法学验证
- 生物信息学分析:利用HDF5格式的特征数据进行线虫行为特征的量化分析与建模