数据集概述
本数据集为秀丽隐杆线虫(C.elegans)MT1236品系(携带egl-40(n606)IV突变)的行为实验数据,属于线虫行为数据库的一部分。记录了成年雌雄同体线虫在特定培养条件下的运动行为,包含视频跟踪数据及特征提取结果,可用于分析该基因突变对虫体行为的影响。
文件详解
- 压缩数据文件
- 文件名称:egl-40 (n606)IV on food R_2010_08_05__12_08_28__5.wcon.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:包含实验相关的压缩数据,可能存储原始或结构化的行为记录信息
- 主数据文件
- 文件名称:egl-40 (n606)IV on food R_2010_08_05__12_08_28__5.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储实验核心数据,可能包含视频帧对应的线虫骨架分割、运动轨迹等原始跟踪信息
- 特征数据文件
- 文件名称:egl-40 (n606)IV on food R_2010_08_05__12_08_28__5_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储提取的行为特征数据,基于tierpsy软件分析得到,包含26893个分割骨架对应的运动特征
数据来源
C.elegans behavioural database(http://movement.openworm.org)
适用场景
- 线虫基因功能研究: 分析egl-40(n606)突变对秀丽隐杆线虫运动行为的影响
- 行为表型分析: 基于视频跟踪数据研究线虫在NGM培养基上的运动模式、速度等行为特征
- 生物实验方法验证: 参考实验方案(如Yemini et al.方法)开展同类线虫行为实验的设计与验证
- 基因-行为关联研究: 探索egl-40基因与线虫特定行为表型的关联机制