数据集概述
本数据集为秀丽隐杆线虫NL1137品系(携带gpa-5(pk376)X突变)的行为实验数据,属于线虫行为数据库的一部分。记录了成虫在含OP50食物的NGM培养基上的行为特征,包括视频数据、骨架分割及行为特征提取结果,可用于分析该基因突变体的行为模式。
文件详解
- 文件名称:gpa-5 (pk376)X on food R_2010_03_05__11_35_4567.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:包含线虫行为实验的原始或处理后视频相关数据
- 文件名称:gpa-5 (pk376)X on food R_2010_03_05__11_35_4567_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储线虫行为特征提取结果,涉及19590个分段骨架等行为特征数据
- 文件名称:gpa-5 (pk376)X on food R_2010_03_05__11_35_4567.wcon.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:压缩存档文件,包含线虫行为数据的wcon格式相关内容
数据来源
C.elegans behavioural database(http://movement.openworm.org)
适用场景
- 线虫基因突变体行为学研究: 分析gpa-5(pk376)X突变对秀丽隐杆线虫运动模式、觅食行为等的影响
- 神经生物学机制探索: 结合基因信息研究gpa-5基因在调控线虫行为中的作用
- 行为实验标准化方法验证: 基于E. Yemini等人的实验方法,验证线虫行为实验的可重复性
- 行为特征提取算法测试: 利用骨架分割数据评估行为分析软件(如tierpsy)的性能