数据集概述
本数据集为秀丽隐杆线虫NL790品系(基因型gpa-4(pk381)IV)的行为实验数据,属于秀丽隐杆线虫行为数据库的一部分。记录了成年雌雄同体线虫在特定培养条件下的行为特征,包含视频跟踪数据、特征提取结果及标准化格式文件,可用于分析线虫的运动行为及基因对行为的影响。
文件详解
- 核心数据文件:
- 文件名称:gpa-4 (pk381)I on food R_2010_02_25__10_26_50__3.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储线虫行为实验的原始跟踪数据,包含视频帧对应的线虫形态、位置等基础信息
- 文件名称:gpa-4 (pk381)I on food R_2010_02_25__10_26_50__3_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储从原始数据中提取的线虫行为特征,如运动轨迹、身体弯曲度等量化指标
- 文件名称:gpa-4 (pk381)I on food R_2010_02_25__10_26_50__3.wcon.zip
- 文件格式:ZIP(含wcon格式文件)
- 字段映射介绍:压缩存储的标准化线虫行为数据文件,遵循wcon格式规范,便于跨平台共享与分析
数据来源
C.elegans behavioural database(http://movement.openworm.org)
适用场景
- 线虫基因功能研究: 分析gpa-4基因对秀丽隐杆线虫行为表型的调控作用
- 模式生物行为学分析: 基于视频跟踪数据研究线虫的运动模式、觅食行为等特征
- 生物实验标准化验证: 参照实验方案(E. Yemini et al.方法)验证线虫行为实验的可重复性
- 行为数据挖掘: 利用特征文件中的量化指标开展线虫行为的多维度统计分析