数据集概述
本数据集属于秀丽隐杆线虫行为数据库,记录了nlp-2(tm1908)X基因敲除株成年雌雄同体线虫的行为实验数据。实验于2010年3月17日在英国MRC分子生物学实验室完成,使用tierpsy软件追踪分析线虫在NGM琼脂培养基上的行为,包含视频处理后的运动特征数据,共3个相关文件。
文件详解
- 核心数据文件(.hdf5格式,2个)
- 文件名称:nlp-2 (tm1908)X on food L_2010_03_17__11_15_54__5.hdf5、nlp-2 (tm1908)X on food L_2010_03_17__11_15_54__5_features.hdf5
- 字段映射介绍:包含线虫运动的骨架分割数据(共20143个分段骨架)、行为特征参数(基于25.7069帧/秒的视频追踪结果,像素分辨率为4.3011微米/像素)
- 压缩数据文件(.zip格式,1个)
- 文件名称:nlp-2 (tm1908)X on food L_2010_03_17__11_15_54__5.wcon.zip
- 内容说明:存储线虫行为数据的压缩文件,采用wcon格式(线虫行为数据标准格式)
数据来源
C.elegans behavioural database(http://movement.openworm.org)
适用场景
- 线虫基因功能研究: 分析nlp-2基因敲除对秀丽隐杆线虫行为模式的影响
- 行为遗传学实验验证: 验证神经肽基因与线虫运动行为的关联
- 模式生物行为分析: 研究成年雌雄同体线虫在标准化培养条件下的行为特征
- 生物图像追踪算法优化: 基于tierpsy软件生成的骨架数据,优化模式生物行为追踪模型
- 线虫行为数据库补充: 为开源线虫行为数据库提供标准化实验数据