数据集概述
本数据集为秀丽隐杆线虫RB1609品系(携带nlp-5基因ok1981突变体)的行为实验数据,记录了成虫在含OP50食物的NGM琼脂培养基中的运动行为,包含视频追踪数据、特征提取结果及标准化格式文件,是研究nlp-5基因功能与线虫行为关联的实验资料。
文件详解
- 核心数据文件
- 文件名称:nlp-5 (ok1981)11 on food L_2009_06_05__11_44__5.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:包含视频追踪原始数据,如线虫骨架坐标、运动轨迹等基础观测信息
- 特征提取文件
- 文件名称:nlp-5 (ok1981)11 on food L_2009_06_05__11_44__5_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储经tierpsy软件提取的行为特征数据,涵盖运动参数、身体姿态等量化指标
- 标准化格式文件
- 文件名称:nlp-5 (ok1981)11 on food L_2009_06_05__11_44__5.wcon.zip
- 文件格式:ZIP(内含wcon格式文件)
- 字段映射介绍:采用wcon标准化格式封装的线虫行为数据,便于跨平台共享与分析
数据来源
C.elegans behavioural database
适用场景
- 模式生物基因功能研究: 分析nlp-5基因ok1981突变对秀丽隐杆线虫运动行为的影响
- 神经生物学行为分析: 基于线虫骨架与运动特征数据,探究神经调控机制与行为表型的关联
- 实验方法标准化验证: 参考E. Yemini等的实验方法,验证基因功能实验的可重复性
- 行为学数据分析工具测试: 利用标准化wcon格式数据,测试或优化线虫行为分析软件性能