数据集概述
本数据集属于秀丽隐杆线虫行为数据库,记录了ocr-4(tm2173)IV品系成年雌雄同体线虫的行为实验数据。实验于2015年7月21日开展,采用NGM低蛋白胨培养基、OP50食物源,通过tierpsy软件追踪线虫行为,包含视频处理后的特征数据与标准化格式文件,共3个文件。
文件详解
- 文件名称:
ocr-4 (tm2173) on food R_2015_07_21__16_26_09___5___4.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:推测为原始行为追踪数据存储文件,包含线虫运动的时空坐标、骨架 segmentation 等基础数据
- 文件名称:
ocr-4 (tm2173) on food R_2015_07_21__16_26_09___5___4.wcon.zip
- 文件格式:ZIP(含WCON格式文件)
- 字段映射介绍:WCON(蠕虫行为交换格式)压缩文件,标准化存储线虫行为时序数据,便于跨平台共享与分析
- 文件名称:
ocr-4 (tm2173) on food R_2015_07_21__16_26_09___5___4_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:行为特征提取文件,包含基于原始追踪数据计算的线虫运动速度、弯曲度、摆尾频率等量化特征
数据来源
C.elegans behavioural database(http://movement.openworm.org)
适用场景
- 线虫基因功能研究: 分析ocr-4基因对秀丽隐杆线虫觅食、运动等行为的调控作用
- 神经行为学实验验证: 验证tierpsy软件追踪线虫行为的准确性与可靠性
- 模式生物行为标准化分析: 基于WCON格式文件开展跨实验室的线虫行为数据整合研究
- 基因-行为关联分析: 探究ocr-4基因突变体与野生型线虫的行为表型差异
- 药物筛选辅助: 作为基准数据评估药物对线虫ocr-4相关行为的影响