数据集概述
本数据集为秀丽隐杆线虫(C.elegans)行为数据库的一部分,记录了FX2173品系(ocr-4(tm2173)IV基因突变体)成年雌雄同体线虫的行为实验数据。实验于2010年3月26日开展,使用tierpsy软件追踪线虫在NGM琼脂培养基上的行为,包含特征数据、原始追踪数据及标准化格式数据,总计3个文件。
文件详解
- 特征数据文件
- 文件名称:ocr-4 (tm2173) on food L_2010_03_26__14_54_38810_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:包含线虫行为特征数据,基于tierpsy软件提取的19045个分段骨架特征
- 原始追踪数据文件
- 文件名称:ocr-4 (tm2173) on food L_2010_03_26__14_54_38810.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:记录实验的原始追踪数据,包含帧率(25.8398帧/秒)、视频像素与微米映射(4.20853微米/像素)等基础参数
- 标准化格式压缩文件
- 文件名称:ocr-4 (tm2173) on food L_2010_03_26__14_54_38810.wcon.zip
- 文件格式:ZIP(内含wcon格式文件)
- 字段映射介绍:以标准化wcon格式存储的线虫行为数据压缩包
数据来源
MRC Laboratory of Molecular Biology(英国剑桥)
适用场景
- 线虫基因突变体行为分析: 研究ocr-4(tm2173)IV基因突变对秀丽隐杆线虫行为模式的影响
- 分子生物学实验验证: 验证线虫行为与基因功能的关联,支持相关基因功能研究
- 行为学实验方法优化: 基于实验方案(如30分钟适应期、追踪软件参数)优化线虫行为观测流程
- 行为特征提取算法评估: 分析tierpsy软件提取的线虫骨架特征有效性,为行为追踪技术提供参考