数据集概述
本数据集为秀丽隐杆线虫行为数据库的一部分,记录了RB2005品系(T28F2.7基因ok2657突变体)成虫的行为实验数据。实验于2015年3月26日在英国MRC分子生物学实验室完成,采用tierpsy软件追踪线虫运动,包含视频处理后的行为特征数据,总计3个文件。
文件详解
- 核心数据文件:
- 文件名称:RB2005 on food R_2015_03_26__11_20_0041.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:包含线虫行为实验的基础数据,可能记录原始追踪信息或骨架数据
- 特征数据文件:
- 文件名称:RB2005 on food R_2015_03_26__11_20_0041_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储线虫行为特征数据,基于tierpsy软件提取的运动特征
- 行为数据压缩文件:
- 文件名称:RB2005 on food R_2015_03_26__11_20_0041.wcon.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:压缩存储的线虫行为数据,格式可能遵循WCON(Worm Behavior Ontology)标准
数据来源
C.elegans behavioural database(http://movement.openworm.org)
适用场景
- 线虫基因功能研究: 分析T28F2.7基因ok2657突变对秀丽隐杆线虫行为的影响
- 行为表型分析: 基于追踪数据研究线虫在食物环境中的运动模式、速度等行为特征
- 神经生物学研究: 结合线虫行为数据探索神经系统与行为调控的关联
- 实验方法验证: 参考E. Yemini等人的实验方法,验证线虫行为实验的标准化流程
- 生物信息学工具应用: 评估tierpsy软件在线虫行为追踪中的效果与特征提取能力