数据集概述
本数据集为秀丽隐杆线虫行为数据库的一部分,记录了RB919品系(携带snf-1(ok790)I基因突变)成年雌雄同体线虫在含OP50食物的NGM琼脂培养基上的行为实验数据,包含视频追踪原始数据、特征提取结果及标准化格式文件。
文件详解
- 文件名称:snf-1 (ok790)I on food L_2009_11_18__15_54_00612.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:推测为实验原始数据文件,可能包含视频帧、线虫位置坐标等基础追踪信息
- 文件名称:snf-1 (ok790)I on food L_2009_11_18__15_54_00612.wcon.zip
- 文件格式:ZIP(含wcon格式文件)
- 字段映射介绍:标准化线虫行为数据归档文件,wcon格式通常包含线虫运动轨迹、姿态等结构化行为数据
- 文件名称:snf-1 (ok790)I on food L_2009_11_18__15_54_00612_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:行为特征提取结果文件,可能包含线虫运动速度、弯曲频率、停留时间等量化特征
数据来源
C.elegans behavioural database(http://movement.openworm.org)
适用场景
- 线虫基因功能研究: 分析snf-1基因对秀丽隐杆线虫觅食、运动等行为的调控作用
- 神经生物学实验验证: 验证E. Yemini等人提出的线虫行为实验方法在特定基因突变体中的适用性
- 行为表型分析: 量化突变体线虫与野生型的行为差异,为代谢相关基因功能研究提供表型数据
- 生物行为数据标准化研究: 基于wcon格式文件探索线虫行为数据的统一存储与交换标准