数据集概述
本数据集为秀丽隐杆线虫行为数据库的一部分,记录了RB738品系(snf-4(ok496)II基因突变)成虫的行为实验数据。实验于2009年11月17日开展,包含视频跟踪数据及特征提取结果,涉及线虫在NGM低蛋白胨琼脂培养基上的运动行为,可用于研究snf-4基因对秀丽隐杆线虫行为的影响。
文件详解
- 文件1:snf-4 (ok496)II on food R_2009_11_17__14_3035_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储线虫行为特征数据,包含由tierpsy软件提取的运动相关特征(基于19520个分割骨架)
- 文件2:snf-4 (ok496)II on food R_2009_11_17__14_3035.wcon.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:压缩包内包含wcon格式的线虫行为轨迹数据,记录实验过程中线虫的运动轨迹信息
- 文件3:snf-4 (ok496)II on food R_2009_11_17__14_3035.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储实验原始或处理后的核心数据,包含视频帧对应的线虫行为记录(实验总时长897.836秒,帧率25.9067帧/秒,像素分辨率4.75979微米/像素)
数据来源
C.elegans behavioural database(http://movement.openworm.org)
适用场景
- 线虫基因功能研究: 分析snf-4(ok496)基因突变对秀丽隐杆线虫运动行为的影响
- 模式生物行为学分析: 基于视频跟踪数据研究线虫在特定培养基(NGM低蛋白胨琼脂)上的行为模式
- 生物实验标准化验证: 参考E. Yemini等人的实验方法,验证线虫行为实验的可重复性
- 行为特征提取算法测试: 利用tierpsy软件生成的特征数据,评估线虫行为特征提取算法的性能