数据集概述
本数据集为秀丽隐杆线虫VC223株系(tom-1(ok285)I突变体)的行为实验数据,属于C.elegans行为数据库的一部分。记录了成年雌雄同体线虫在NGM低蛋白胨培养基、OP50食物条件下的行为特征,包含视频追踪原始数据及特征提取结果,用于研究tom-1基因对秀丽隐杆线虫行为的影响。
文件详解
- 行为数据压缩包
- 文件名称:tom-1 (ok1285) on food L_2010_07_29__11_57_42__4.wcon.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:包含线虫行为视频追踪的原始数据压缩文件
- 行为特征主文件
- 文件名称:tom-1 (ok1285) on food L_2010_07_29__11_57_42__4.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储线虫行为追踪的核心数据,包含26288个分段骨架信息,对应899秒实验时长、每秒约30帧的视频数据
- 行为特征扩展文件
- 文件名称:tom-1 (ok1285) on food L_2010_07_29__11_57_42__4_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储经tierpsy软件提取的线虫行为特征数据,包含视频像素与实际长度的映射(4.56732微米/像素)等参数
数据来源
C.elegans behavioural database(http://movement.openworm.org)
适用场景
- 基因功能研究:分析tom-1基因对秀丽隐杆线虫运动行为的调控机制
- 行为学特征分析:基于分段骨架数据研究线虫的运动模式、速度、轨迹等行为参数
- 模式生物实验复现:参考实验方案(E. Yemini et al.方法)开展同类线虫行为实验
- 行为数据分析方法验证:使用tierpsy软件提取的特征数据,验证线虫行为分析算法的有效性