数据集概述
本数据集为秀丽隐杆线虫行为数据库的一部分,记录了TQ225品系(携带trp-1(sy690)III基因突变)成年雌雄同体线虫的行为实验数据。实验在含OP50食物的NGM琼脂培养基中开展,使用tierpsy软件追踪分析线虫运动行为,包含原始视频衍生数据及特征提取结果。
文件详解
- 行为数据压缩包
- 文件名称:trp-1 (sy691) on food L_2010_04_23__11_37_2216.wcon.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:包含线虫行为追踪的原始衍生数据,格式遵循wcon标准
- 特征数据文件
- 文件名称:trp-1 (sy691) on food L_2010_04_23__11_37_2216_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储线虫行为特征提取结果,包含运动轨迹、速度等行为学参数
- 原始追踪数据文件
- 文件名称:trp-1 (sy691) on food L_2010_04_23__11_37_2216.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:记录线虫行为追踪的原始数据,包含19067个分段骨架数据,帧率25.7732帧/秒,视频像素分辨率4.29558微米/像素
数据来源
C.elegans behavioural database
适用场景
- 线虫遗传学研究:分析trp-1基因突变对秀丽隐杆线虫行为表型的影响
- 模式生物行为学分析:探究线虫在食物环境中的运动模式、觅食行为规律
- 神经生物学机制研究:结合基因功能,解析trp通道参与的线虫行为调控通路
- 行为追踪技术验证:评估tierpsy软件在模式生物行为分析中的应用效果
- 实验方法标准化:参考E. Yemini等人的实验方案,优化线虫行为学实验流程