数据集概述
本数据集为秀丽隐杆线虫(C.elegans)CB109 unc-16(e109)III品系的行为实验数据,属于线虫行为数据库的一部分。记录了成年雌雄同体线虫在特定培养条件下的行为特征,包含视频分析数据、特征提取数据等,可用于研究unc-16基因突变对秀丽隐杆线虫行为的影响。
文件详解
- 行为轨迹数据文件:
- 文件名称:
unc-16 (e109) on food L_2009_12_11__12_23_44__2.wcon.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:包含线虫行为轨迹的wcon格式压缩数据,记录线虫运动的时空信息。
- 特征提取数据文件:
- 文件名称:
unc-16 (e109) on food L_2009_12_11__12_23_44__2_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储通过tierpsy软件提取的线虫行为特征数据,包括运动速度、身体弯曲度等行为指标。
- 原始分析数据文件:
- 文件名称:
unc-16 (e109) on food L_2009_12_11__12_23_44__2.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:包含实验的原始分析数据,如视频帧信息、线虫骨架分割数据(共22135个分割骨架)等。
数据来源
C.elegans behavioural database
适用场景
- 线虫行为学研究:分析unc-16基因突变体的运动模式、行为特征与野生型的差异。
- 基因功能验证:探究unc-16基因在秀丽隐杆线虫行为调控中的作用机制。
- 神经生物学实验:结合线虫神经回路结构,研究基因突变对神经行为的影响。
- 模式生物实验方法优化:参考实验方案(如 habituation 处理、视频采集参数)优化线虫行为实验设计。