数据集概述
本数据集为秀丽隐杆线虫行为数据库的一部分,记录了CB1562品系vab-7(e1562)III突变体成虫的行为实验数据。实验在特定培养基和环境下进行,包含视频跟踪数据及特征分析结果,可用于研究该基因突变对线虫行为的影响。
文件详解
- 核心数据文件(.hdf5格式)
- 文件名称:vab-7 (e1562)III on food R_2011_10_13__14_56_2268.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储线虫行为实验的原始跟踪数据,包含23939个分段骨架信息,对应899.033秒实验时长、30.03帧/秒帧率
- 特征分析文件(.hdf5格式)
- 文件名称:vab-7 (e1562)III on food R_2011_10_13__14_56_2268_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:包含线虫行为特征提取结果,基于tierpsy软件分析生成
- 标准格式压缩文件(.zip格式)
- 文件名称:vab-7 (e1562)III on food R_2011_10_13__14_56_2268.wcon.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:压缩存储符合WCON标准格式的线虫行为数据
数据来源
C.elegans behavioural database(http://movement.openworm.org)
适用场景
- 线虫基因功能研究:分析vab-7基因突变对线虫行为模式的影响
- 分子生物学实验验证:验证E. Yemini等人实验方法在特定突变体中的应用效果
- 行为特征提取算法测试:基于tierpsy软件生成的特征数据,优化线虫行为分析算法
- 模式生物行为数据库补充:作为秀丽隐杆线虫行为数据库的组成部分,支持大规模行为组学研究