数据集概述
本数据集为秀丽隐杆线虫行为数据库的一部分,记录了FX2146品系(基因型ser-6(tm2146)IV)成虫的行为实验数据。实验于2009年12月开展,采用NGM低蛋白胨培养基、OP50食物源,经30分钟适应后录制行为视频,通过Tierpsy软件提取行为特征,包含3个数据文件。
文件详解
- 行为特征数据文件
- 文件名称:ser-6 (tm2146) on food R_2009_12_14__12_25_03__6_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:包含线虫行为特征数据,具体特征字段基于Tierpsy软件提取的行为参数(如运动轨迹、身体姿态等,未提供详细字段列表)
- 核心数据文件
- 文件名称:ser-6 (tm2146) on food R_2009_12_14__12_25_03__6.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:实验核心数据文件,存储原始或处理后的线虫行为记录数据
- 压缩数据文件
- 文件名称:ser-6 (tm2146) on food R_2009_12_14__12_25_03__6.wcon.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:压缩格式的行为数据文件,包含wcon格式的线虫行为记录(wcon为线虫行为数据标准格式)
数据来源
C.elegans behavioural database(http://movement.openworm.org)
适用场景
- 线虫基因功能研究: 分析ser-6基因(tm2146突变体)对秀丽隐杆线虫行为的影响
- 行为表型分析: 基于视频提取的特征数据,研究线虫在食物源环境下的运动、觅食等行为模式
- 实验方法验证: 参考E. Yemini等人的实验方法,验证线虫行为实验的标准化流程
- 行为数据分析工具测试: 用于Tierpsy等线虫行为分析软件的结果验证与方法优化