数据集概述
本数据集属于秀丽隐杆线虫行为数据库,记录了NL2330品系(携带gpa-13(pk1270)V等位基因)成年雌雄同体线虫的行为实验数据。实验在含OP50食物的NGM琼脂培养基中进行,使用tierpsy软件追踪分析,包含线虫运动轨迹、骨架特征等数据,可用于研究gpa-13基因对秀丽隐杆线虫行为的影响。
文件详解
- 文件名称:gpa-13 (p1270)V on food L_2010_03_04__10_02_3214.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储线虫行为实验的原始或核心追踪数据(具体字段未明确说明,推测包含视频帧、原始轨迹等基础信息)
- 文件名称:gpa-13 (p1270)V on food L_2010_03_04__10_02_3214.wcon.zip
- 文件格式:ZIP(包含WCONTROL格式文件)
- 字段映射介绍:压缩包内为WCONTROL格式的线虫行为数据,通常用于标准化存储线虫运动轨迹与行为参数
- 文件名称:gpa-13 (p1270)V on food L_2010_03_04__10_02_3214_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储线虫行为特征数据,包含19778个分段骨架数据,推测涵盖运动速度、身体弯曲度、轨迹形态等提取后的特征参数
数据来源
C.elegans behavioural database(http://movement.openworm.org)
适用场景
- 线虫基因功能研究: 分析gpa-13基因对秀丽隐杆线虫运动行为的调控作用
- 神经生物学实验: 探究gpa-13基因相关神经通路与线虫行为表型的关联
- 模式生物行为学分析: 利用标准化行为数据开展秀丽隐杆线虫行为模式的定量研究
- 基因与环境互作研究: 结合食物条件(OP50)分析gpa-13基因突变体在特定环境下的行为响应
- 行为追踪技术验证: 基于tierpsy软件生成的特征数据,评估线虫行为追踪算法的准确性与适用性