数据集概述
本数据集为秀丽隐杆线虫NL334品系(携带gpa-2(pk16)V基因突变)的行为实验数据,属于C.elegans行为数据库的一部分。实验记录了成虫在含OP50食物的NGM琼脂环境中的行为,包含视频文件及处理后的特征数据,可用于分析基因突变对秀丽隐杆线虫行为的影响。
文件详解
- 核心数据文件(.hdf5格式)
- 文件名称:gpa-2 (pk16)V on food R_2010_03_04__12_44_54412.hdf5、gpa-2 (pk16)V on food R_2010_03_04__12_44_54412_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:包含线虫行为的原始记录与特征数据,涉及20960个分割骨架信息,关联实验参数(如帧率26.455帧/秒、视频像素对应4.39316微米)及行为特征提取结果
- 压缩数据文件(.zip格式)
- 文件名称:gpa-2 (pk16)V on food R_2010_03_04__12_44_54412.wcon.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:包含线虫行为数据的压缩文件,具体内容需解压后查看
数据来源
C.elegans behavioural database(http://movement.openworm.org)
适用场景
- 线虫行为遗传学研究: 分析gpa-2基因对秀丽隐杆线虫运动行为的调控作用
- 模式生物行为学分析: 基于视频特征数据研究线虫在特定环境中的行为模式
- 基因功能验证: 验证gpa-2(pk16)V突变体的表型特征,探索G蛋白信号通路与行为的关联
- 实验方法复现: 参考实验方案(E. Yemini等方法)复现线虫行为学实验,优化实验流程