数据集概述
本数据集为秀丽隐杆线虫行为数据库的一部分,记录了RB1523品系(C24G7.1(ok1822)I基因编辑)成年雌雄同体线虫在含OP50食物的NGM培养基上的行为实验数据,包含视频及处理后的特征数据,用于研究该基因相关的线虫行为特征。
文件详解
- 实验数据文件(.hdf5格式)
- 文件名称:C24G7.1 (ok1822) on food L_2010_03_30__12_06_4223.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储线虫行为实验的原始或基础数据,包含视频帧、线虫骨架分割等实验记录信息
- 特征数据文件(.hdf5格式)
- 文件名称:C24G7.1 (ok1822) on food L_2010_03_30__12_06_4223_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储处理后的线虫行为特征数据,包含19618个分割骨架相关的特征信息
- 行为数据压缩文件(.wcon.zip格式)
- 文件名称:C24G7.1 (ok1822) on food L_2010_03_30__12_06_4223.wcon.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:压缩存储线虫行为的标准化格式数据,包含实验时长(898.28秒)、帧率(25.4453帧/秒)、像素分辨率(4.1716微米/像素)等参数对应的行为记录
数据来源
C.elegans behavioural database(http://movement.openworm.org)
适用场景
- 线虫基因功能研究:分析C24G7.1基因编辑对线虫行为的影响,探究基因与行为的关联
- 线虫行为学实验分析:基于视频及特征数据,研究线虫在食物环境中的运动、觅食等行为模式
- 生物实验方法验证:参考该实验的Habituation、Protocol等流程,验证线虫行为实验方法的重复性
- 行为数据分析工具测试:使用该数据集测试tierpsy等线虫行为分析软件的性能与准确性