数据集概述
本数据集为秀丽隐杆线虫NL1146品系(gpa-6(pk480)X突变体)的行为实验数据,属于线虫行为数据库的一部分。记录了成年雌雄同体线虫在含OP50食物的NGM琼脂培养基中的行为特征,包含视频追踪数据、行为特征数据等,可用于分析该基因突变体的行为模式。
文件详解
- 核心数据文件(HDF5格式)
- 文件名称:gpa-6 (ph480)X on food R_2010_03_04__12_02_55110.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储线虫行为的原始追踪数据,包含19753个分割骨架数据,记录线虫运动的空间坐标及时序信息
- 行为特征文件(HDF5格式)
- 文件名称:gpa-6 (ph480)X on food R_2010_03_04__12_02_55110_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储提取的线虫行为特征数据,基于tierpsy软件分析得到,包含运动速度、弯曲频率等行为学指标
- 行为数据压缩文件(ZIP格式)
- 文件名称:gpa-6 (ph480)X on food R_2010_03_04__12_02_55110.wcon.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:压缩存储的线虫行为数据,采用wcon格式记录行为时序信息
数据来源
C.elegans behavioural database(http://movement.openworm.org)
适用场景
- 线虫基因功能研究: 分析gpa-6基因对秀丽隐杆线虫运动行为的调控作用
- 神经生物学实验: 探究线虫神经系统突变体的行为表型特征
- 生物行为学分析: 基于视频追踪数据研究线虫在食物环境中的运动模式和觅食行为
- 实验方法验证: 参考E. Yemini等人的实验方法,验证线虫行为实验的标准化流程
- 基因与行为关联分析: 结合突变体信息和行为数据,建立基因功能与行为表型的关联模型