数据集概述
本数据集为秀丽隐杆线虫行为数据库的一部分,记录了RB607品系(nlp-12(ok335)IV基因变异)成年雌雄同体线虫的行为实验数据。实验在含OP50食物的NGM琼脂培养基中进行,使用tierpsy软件追踪分析,包含线虫运动轨迹、骨架特征等量化数据,支持基因功能与行为表型关联研究。
文件详解
- 核心数据文件(HDF5格式)
- 文件名称:nlp-12 (ok335)IV on food R_2010_03_12__10_5534.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储线虫行为实验的原始追踪数据,包含视频帧对应时间、线虫位置坐标等基础信息
- 特征数据文件(HDF5格式)
- 文件名称:nlp-12 (ok335)IV on food R_2010_03_12__10_5534_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:包含线虫行为特征量化数据,如运动速度、身体弯曲度、骨架节点坐标等15172个分割骨架特征
- 标准化数据压缩包(ZIP格式)
- 文件名称:nlp-12 (ok335)IV on food R_2010_03_12__10_5534.wcon.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:包含采用wcon格式标准化的线虫行为数据,支持跨平台数据交换与分析
数据来源
C.elegans behavioural database(http://movement.openworm.org)
适用场景
- 线虫基因功能研究: 分析nlp-12基因变异对秀丽隐杆线虫运动行为的影响,探究神经肽基因的调控机制
- 行为表型量化分析: 利用骨架特征、运动轨迹等数据,建立线虫行为表型的量化评估模型
- 实验方法验证: 参考Yemini等人的实验方案,验证线虫行为学实验的标准化流程
- 生物信息学工具测试: 作为tierpsy追踪软件的应用案例,测试行为数据分析工具的性能与准确性