数据集概述
本数据集是秀丽隐杆线虫行为数据库的一部分,记录了RB1374品系(ocr-3(ok1559)X基因)成年雌雄同体线虫在NGM低蛋白胨培养基上的行为实验数据。实验由剑桥MRC分子生物学实验室完成,包含视频记录及经Tierpsy软件分析的行为特征数据,支持线虫基因功能与行为关联研究。
文件详解
- 行为数据压缩文件
- 文件名称:ocr-3 (ok1557) on food R_2010_04_22__11_2837.wcon.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:包含线虫行为记录的原始或标准化数据压缩包
- 特征数据文件
- 文件名称:ocr-3 (ok1557) on food R_2010_04_22__11_2837_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:经Tierpsy软件提取的线虫行为特征数据,包含运动轨迹、姿态等量化指标
- 核心数据文件
- 文件名称:ocr-3 (ok1557) on food R_2010_04_22__11_2837.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:实验核心数据文件,包含15336个分割骨架数据,记录线虫899.795秒内的行为信息,帧率为每秒18.3486帧,像素分辨率为每像素4.02599微米
数据来源
C.elegans behavioural database(http://movement.openworm.org)
适用场景
- 线虫基因功能研究: 分析ocr-3基因对秀丽隐杆线虫行为模式的影响
- 行为学实验方法验证: 参考E. Yemini等人的实验方法,验证线虫行为学研究的标准化流程
- 生物图像分析技术应用: 基于Tierpsy软件的分析结果,研究线虫行为特征的自动化提取方法
- 神经生物学机制探索: 结合基因背景与行为数据,探索线虫神经调控的分子机制
- 模式生物数据库补充: 为秀丽隐杆线虫行为数据库提供标准化的实验数据支持