数据集概述
本数据集为秀丽隐杆线虫行为数据库的一部分,记录了IK130菌株(pkc-1(nj3)V基因突变体)成虫的行为实验数据。实验在NGM低蛋白胨培养基上进行,包含视频追踪数据及行为特征提取结果,可用于分析pkc-1基因对秀丽隐杆线虫运动行为的影响。
文件详解
- 文件名称:pkc-1 (nj3) on food R_2010_07_29__12_36_3586.wcon.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:包含线虫行为轨迹的wcon格式压缩文件,记录线虫运动的时空坐标等原始追踪数据
- 文件名称:pkc-1 (nj3) on food R_2010_07_29__12_36_3586.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储线虫行为实验的原始视频追踪数据,包含26872个分段骨架数据,帧率约每秒30帧,视频像素分辨率为每像素约4.53微米
- 文件名称:pkc-1 (nj3) on food R_2010_07_29__12_36_3586_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储由tierpsy软件提取的线虫行为特征数据,包含运动速度、弯曲度、身体姿态等量化行为指标
数据来源
C.elegans behavioural database(http://movement.openworm.org)
适用场景
- 线虫基因功能研究: 分析pkc-1基因突变对秀丽隐杆线虫运动行为的影响,探究该基因在神经调控中的作用
- 模式生物行为学分析: 利用行为特征数据研究线虫的运动模式、觅食行为等基本行为规律
- 基因-行为关联分析: 建立pkc-1基因表达与线虫行为表型之间的关联模型
- 行为追踪技术验证: 评估tierpsy软件在秀丽隐杆线虫行为量化分析中的应用效果
- 神经科学基础研究: 为理解神经信号通路对行为调控的分子机制提供实验数据支持