数据集概述
本数据集为秀丽隐杆线虫CB402菌株(unc-55(e402)I基因突变体)的行为实验数据,属于秀丽隐杆线虫行为数据库的一部分。记录了成年雌雄同体线虫在含OP50食物的NGM琼脂培养基中的行为表现,包含视频追踪数据及提取的行为特征,可用于研究unc-55基因对秀丽隐杆线虫行为的影响。
文件详解
- 行为数据压缩包
- 文件名称:unc-55 (e402)I on food R_2011_11_04__10_10_5472.wcon.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:包含秀丽隐杆线虫行为实验的原始或标准化行为数据(wcon格式)
- 特征数据文件
- 文件名称:unc-55 (e402)I on food R_2011_11_04__10_10_5472_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储由tierpsy软件提取的线虫行为特征数据
- 核心数据文件
- 文件名称:unc-55 (e402)I on food R_2011_11_04__10_10_5472.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:包含实验的基础数据,如视频追踪的骨架数据(共两万五千七百二十一个分段骨架)、时间参数(总时长约九百秒,帧率约每秒三十帧)等
数据来源
C.elegans behavioural database(http://movement.openworm.org)
适用场景
- 线虫行为遗传学研究: 分析unc-55基因突变对秀丽隐杆线虫运动行为的影响
- 模式生物行为特征提取: 利用tierpsy软件提取的特征数据,研究线虫行为模式
- 神经发育相关基因功能分析: 探究unc-55基因在神经发育及行为调控中的作用
- 线虫行为实验方法验证: 参考实验方案(Yemini等人方法)验证类似行为实验的设计与执行
- 基因突变体表型分析: 对比野生型与突变体线虫的行为差异,解析基因功能