数据集概述
本数据集是秀丽隐杆线虫(C.elegans)行为数据库的一部分,记录了RB2351品系(trpa-2基因ok3189突变型)成年雌雄同体线虫在NGM低蛋白胨培养基上的行为实验数据。实验由英国MRC分子生物学实验室完成,包含视频跟踪数据、行为特征数据及相关元信息,用于研究trpa-2基因突变对线虫行为的影响。
文件详解
- 文件名称:M05B5.6 (ok3189) on food R_2010_04_22__10_0833.wcon.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:包含线虫行为轨迹数据的压缩文件,可能记录线虫运动的时空坐标等基础行为信息
- 文件名称:M05B5.6 (ok3189) on food R_2010_04_22__10_0833_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:线虫行为特征数据文件,由tierpsy软件生成,可能包含运动速度、身体弯曲度等提取的行为特征参数
- 文件名称:M05B5.6 (ok3189) on food R_2010_04_22__10_0833.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:线虫行为原始或处理后的数据文件,可能包含视频帧对应的线虫形态、位置等详细数据
数据来源
C.elegans behavioural database(http://movement.openworm.org)
适用场景
- 线虫遗传学研究: 分析trpa-2基因突变对线虫行为模式的影响,探究该基因的功能
- 模式生物行为学分析: 利用标准化实验数据研究线虫在特定培养基和食物条件下的行为特征
- 行为遗传学实验验证: 为验证trpa-2基因与行为表型的关联提供原始实验数据支持
- 生物信息学算法测试: 作为tierpsy等行为分析软件的测试数据集,优化线虫行为特征提取算法