数据集概述
本数据集属于秀丽隐杆线虫行为数据库(C.elegans behavioural database),记录了基因编辑品系LX982(携带ocr-1、ocr-2、ocr-4基因突变)成年雌雄同体线虫的行为实验数据。实验于2010年3月19日开展,使用tierpsy软件追踪线虫在NGM培养基上的运动行为,包含行为特征、原始追踪数据及标准化格式文件,共3个文件。
文件详解
- 行为特征文件:
- 文件名称:
ocr-4;2;1 on food R_2010_03_19__11_03_02___7___7_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储线虫行为特征数据,包含由tierpsy软件提取的运动相关特征参数(如骨架数据、运动轨迹等)
- 原始追踪数据文件:
- 文件名称:
ocr-4;2;1 on food R_2010_03_19__11_03_02___7___7.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储线虫行为原始追踪数据,包含实验过程中的基础观测数据
- 标准化格式压缩文件:
- 文件名称:
ocr-4;2;1 on food R_2010_03_19__11_03_02___7___7.wcon.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:包含wcon格式的线虫行为数据压缩包,用于标准化数据交换
数据来源
C.elegans behavioural database(http://movement.openworm.org)
适用场景
- 线虫神经行为学研究: 分析ocr基因家族突变对秀丽隐杆线虫运动行为的影响机制
- 基因功能表型分析: 探究ocr-1、ocr-2、ocr-4基因突变体的行为表型特征
- 行为追踪技术验证: 基于tierpsy软件的线虫行为追踪数据,验证行为分析算法的有效性
- 实验室标准化实验参考: 参考实验方案(如30分钟适应期、OP50食物条件)设计同类线虫行为实验