数据集概述
本数据集是秀丽隐杆线虫(C.elegans)行为数据库的一部分,记录了NL332菌株(gpa-1(pk15)V基因变异)成年雌雄同体线虫的行为实验数据。实验于2010年3月4日在英国MRC分子生物学实验室开展,使用tierpsy软件追踪线虫在含OP50食物的培养皿中的行为,包含视频处理后的骨架分段及特征数据,总计3个文件。
文件详解
- 文件名称:gpa-1 (pk15)V on food R_2010_03_04__12_25_36__11.wcon.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:可能包含线虫行为轨迹的标准化格式数据,具体字段需解压后查看
- 文件名称:gpa-1 (pk15)V on food R_2010_03_04__12_25_36__11.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:科学数据存储格式,可能包含原始视频处理后的基础行为数据
- 文件名称:gpa-1 (pk15)V on food R_2010_03_04__12_25_36__11_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:包含线虫行为特征数据,如20031个分段骨架信息,对应实验总时长897.897秒、帧率25.641帧/秒、像素分辨率4.3011微米/像素
数据来源
C.elegans behavioural database(http://movement.openworm.org)
适用场景
- 线虫基因功能研究:分析gpa-1(pk15)V基因突变对秀丽隐杆线虫行为的影响
- 神经生物学实验:探究线虫神经回路与行为表型的关联
- 行为学数据分析方法验证:测试tierpsy等行为追踪软件在模式生物行为分析中的应用效果
- 遗传学与行为学交叉研究:为基因变异与动物行为表型的关联分析提供实验数据支持